芜湖市热启动Taq酶标准
发布时间:2023-09-06 01:26:10芜湖市热启动Taq酶标准
分子诊断中游主要是分子诊断试剂和仪器两类产品的研发、生产和销售,国内试剂发展较为迅速,而国产仪器占比相对较小。 分子诊断试剂盒包括核酸提取试剂盒和核酸检测试剂盒,基本已经国产化。HBV(乙肝病毒)、HCV(丙肝病毒)、HIV(艾滋病毒)等常见病毒的核酸检测试剂国内生产厂家数均远大于国外厂家。甲型、乙型、丙型流感等常见疾病的核酸检测试剂盒已经比较成熟,竞争厂家较多,几乎全部为国产品牌。
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热启动PCR(hot start PCR)是指使Taq DNA 聚合酶只有在样品温度至少超过70℃时才发挥作用的PCR,可提高反应的特异性。Taq DNA 聚合酶通常在比适宜温度低得多的条件下仍有较强的活性。PCR 反应的初加热过程中,样品温度上升到70℃之前,在较低的温度下引物可能与部分单链模板形成非特异性结合,并在Taq DNA 聚合酶的作用下延伸。结果会导致非靶序列的扩增,影响反应的特异性。热启动可减少非靶序列的扩增,提高反应的特异性。在引物设计时如果某位点因为遗传元件的定位而受限,如site-directed 突变、表达克隆或用于DNA 工程的遗传元件的构建和操作等情况,热启动PCR 尤为有效。
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热启动Taq酶的产生:在PCR的反应过程中,主要有三个阶段:变性、复性、延伸。Taq DNA聚合酶的复性温度是72℃,但其在低温下也有活性(活性较弱),也能催化引物与模板复性,只是错配率高,发生非特异性复性机率大。这样在未达到72℃之前,反应在Taq酶聚合下不断扩增出非特异性产物,而使实验失败。在传统的PCR反应中,这样由低温上升至高温的过程中,引物错配和二聚体的形成机率非常高,Hot Start Taq DNA聚合酶就是让PCR反应一开始就在大于70℃下进行。当温度较低时,酶活性被封闭,当温度大于一定温度时酶又开始工作。这样就避免了在低温下复性、延伸的过程,消除引物错配和二聚体形成,减少非特异性产物的产生。我们是如何对Hotstart Taq酶修饰而让它只在高温下才能发挥活性?这就是Hot Start taq酶的作用原理。
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常规普通PCR常见问题:1. 优化反应条件,梯度摸索退火温度,延长退火延伸时间,增加反应循环数(30-45区间为宜)。2. 对核酸模板进行纯化,或使用商业化核酸提取试剂盒进行提取,增加核酸模板的上样量。3. 优化反应体系(预混体系除外),改变检测体系中的Mg2+浓度及dNTPs用量,更换体系中Buffer。4. 重新设计引物,避免引物二聚体和链内二级结构,在一次稀释引物后可分装成多支小管,减少反复冻融次数。